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Physique-chimie pour la santé (ST2S) · Première · Analyser et diagnostiquer

Les molécules organiques

Lire une molécule et sa fonction.

En bref

Glucose, éthanol, paracétamol, urée : les molécules du vivant et des médicaments sont organiques, bâties sur un squelette d'atomes de carbone.

Glucose, éthanol, paracétamol, urée : les molécules du vivant et des médicaments sont organiques, bâties sur un squelette d'atomes de carbone. Savoir les lire est indispensable pour analyser un milieu biologique.

Les liaisons covalentes

Une liaison covalente est une mise en commun de deux électrons entre deux atomes. Chaque atome forme un nombre fixe de liaisons :

L'atomeNombre de liaisons
Hydrogène H1
Oxygène O2
Azote N3
Carbone C4

Deux liaisons entre les mêmes atomes forment une double liaison (C=O, C=C).

Quatre façons d'écrire une molécule

La représentationCe qu'elle montreL'éthanol
Formule bruteLe nombre d'atomes de chaque sorteC₂H₆O
Formule développéeToutes les liaisonsChaque H relié à son atome
Semi-développéeLes liaisons, sauf celles avec HCH₃–CH₂–OH
TopologiqueLe squelette en ligne brisée, sans C ni H écritsUn segment terminé par OH

Dans l'écriture topologique, chaque extrémité et chaque sommet de la ligne brisée porte un carbone ; les hydrogènes liés aux carbones sont sous-entendus.

Les fonctions chimiques

Un groupe d'atomes caractéristique confère à la molécule des propriétés : c'est une fonction.

La fonctionLe groupe caractéristiqueExemple
AlcoolC–OH (carbone lié à quatre atomes)Éthanol
Aldéhyde–CHO, en bout de chaîneÉthanal
CétoneC=O au milieu de la chaînePropanone (acétone)
Acide carboxylique–COOHAcide éthanoïque
Ester–COO– entre deux chaînesÉthanoate d'éthyle
ÉtheroxydeC–O–CÉthoxyéthane
AmineC–N (N lié à des C ou H)Méthylamine CH₃–NH₂
Amide–CO–N–Urée, liaison peptidique

Méthode : repère d'abord l'oxygène ou l'azote, regarde ses voisins, puis nomme la fonction.

La nomenclature

Le nom vient du nombre de carbones de la chaîne principale (méth- 1, éth- 2, prop- 3, but- 4, pent- 5, hex- 6) suivi d'une terminaison selon la fonction : -ol (alcool), -al (aldéhyde), -one (cétone), acide …-oïque. Un chiffre indique la position du groupe : propan-2-ol.

L'isomérie de constitution

Deux isomères ont la même formule brute mais des formules développées différentes : ce sont des molécules différentes, aux propriétés différentes.

Exemple : C₂H₆O est à la fois l'éthanol CH₃–CH₂–OH (un alcool, liquide) et le méthoxyméthane CH₃–O–CH₃ (un étheroxyde, gazeux). De même, le glucose et le fructose sont deux isomères de formule C₆H₁₂O₆.

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6 questions pour vérifier

Touche une réponse : la correction s’affiche tout de suite.

  1. 1.Combien de liaisons covalentes forme un atome de carbone ?

  2. 2.Combien de liaisons covalentes forme un atome d’azote ?

  3. 3.Quel groupe caractérise la fonction acide carboxylique ?

  4. 4.CH₃–CO–CH₃ (propanone) possède une fonction :

  5. 5.Que sont deux isomères de constitution ?

  6. 6.Quelle est la formule brute de l’éthanol CH₃–CH₂–OH ?

0 / 6 questions

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