Biochimie, biologie et biotechnologie (STL) · Terminale · T3 – Caractériser pour identifier des micro-organismes
Identifier une souche : morphologie, métabolisme et galeries
Un indice après l’autre.
En bref
Identifier une bactérie, c’est comme identifier un suspect : on commence par l’allure générale, puis on accumule des indices jusqu’à ce qu’un seul nom reste possible.
Toujours partir d’une souche pure
Une identification n’a de sens que sur une souche pure : une seule espèce, issue d’une colonie isolée. On vérifie la pureté (aspect homogène des colonies, un seul type de cellules au microscope) avant tout test.
Les caractères morphologiques
- Aspect des colonies : taille, forme, bord, couleur, surface.
- État frais : forme (coque, bacille), groupement, mobilité.
- Coloration de Gram : Gram positif ou négatif.
Ces premiers résultats orientent vers une famille et le choix des tests suivants.
Les caractères métaboliques
| Test | Ce qu’il révèle |
|---|---|
| Type respiratoire (gélose profonde) | aérobie strict, anaérobie strict, aéro-anaérobie facultatif, microaérophile |
| Catalase (eau oxygénée : bulles) | enzyme qui détruit H₂O₂, présente chez la plupart des aérobies |
| Oxydase | présence d’un cytochrome de la chaîne respiratoire |
| Voie d’attaque du glucose (milieu à indicateur coloré) | oxydative ou fermentative |
| Nitrate réductase | respiration anaérobie sur nitrate |
| Exo-enzymes (gélose à l’amidon, à la caséine) | enzymes sécrétées qui hydrolysent des macromolécules |
| Auxanogramme | quelles sources de carbone permettent la croissance sur milieu synthétique |
Un indicateur de pH vire quand la dégradation des glucides produit des métabolites acides, ou quand celle des peptones alcalinise le milieu.
Une exo-enzyme se voit autour de la colonie : un halo clair sur gélose à l’amidon révélée au lugol signe une amylase sécrétée.
Deux démarches d’identification
| Méthode | Principe | Usage |
|---|---|---|
| Dichotomique | une clé : chaque test partage les possibilités en deux | orienter vers la famille, le genre |
| Probabiliste | une galerie de tests miniaturisés ; le profil obtenu est comparé à une base de données | nommer l’espèce avec un pourcentage de certitude |
Une micro-galerie donne un profil numérique : chaque groupe de trois tests est codé par une somme (1, 2, 4), et le code est lu dans un logiciel ou un catalogue.
Un test sans témoin ne prouve rien : on vérifie la réactivité des réactifs sur une souche connue positive et une souche connue négative.
Exemple travaillé
Bacilles Gram négatif, mobiles, oxydase négative, catalase positive, glucose fermenté avec gaz, nitrate réduit : on s’oriente vers les entérobactéries. La galerie donne le profil 5 144 572, lu comme Escherichia coli avec une très bonne identification.
Teste-toi
6 questions pour vérifier
Touche une réponse : la correction s’affiche tout de suite.
1.Avant toute identification, il faut s’assurer…
2.La mobilité s’observe…
3.Une bactérie qui ne pousse qu’en surface d’une gélose profonde est…
4.Des bulles au contact de l’eau oxygénée révèlent…
5.Un halo clair autour des colonies sur gélose à l’amidon révélée au lugol indique…
6.L’auxanogramme étudie…
0 / 6 questions
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La fiche de révision, sur une page
Tout « Identifier une souche » sur une seule page A4 illustrée : l’essentiel, les pièges et un mini-test. Elle se débloque dans l’app avec des gemmes — et ton compte gratuit en offre assez pour tes trois premières fiches.
