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Chimie, biologie et physiopathologie humaines (ST2S) · Terminale · Chimie : faire des choix autonomes et responsables

Protéines et lipides : la structure au service de la fonction

La structure dicte la fonction.

En bref

Pourquoi une protéine mal repliée ne fonctionne plus ?

Pourquoi une protéine mal repliée ne fonctionne plus ? Pourquoi conseille-t-on de limiter certaines graisses ? Les réponses tiennent à la structure des molécules.

Les acides α-aminés

Un acide α-aminé porte, sur un même atome de carbone (le carbone α), un groupe carboxyle –COOH, un groupe amine –NH₂, un atome d'hydrogène et une chaîne latérale R.

Formule générale : H₂N–CH(R)–COOH

Vingt acides aminés entrent dans la composition des protéines humaines ; ils diffèrent par leur chaîne R (R = H pour la glycine, R = CH₃ pour l'alanine).

Carbone asymétrique et chiralité

Un carbone asymétrique est lié à quatre groupes différents. Une molécule qui en possède un est chirale : elle n'est pas superposable à son image dans un miroir, comme une main gauche et une main droite. Les deux formes sont des énantiomères.

  • En représentation de Cram, deux liaisons sont dans le plan, un trait plein en coin vient vers l'observateur, un trait hachuré s'en éloigne.
  • En représentation de Fischer, on place –COOH en haut et R en bas : si –NH₂ est à gauche, c'est l'énantiomère L ; à droite, c'est D.

Les protéines humaines sont construites avec des acides aminés L. La glycine, dont R = H, n'a pas de carbone asymétrique : elle n'est pas chirale.

La liaison peptidique

Deux acides aminés se lient par condensation : le –COOH de l'un réagit avec le –NH₂ de l'autre, avec élimination d'une molécule d'eau. Le groupe formé, –CO–NH–, est la liaison peptidique.

Glycine + alanine → Gly-Ala + H₂O (l'ordre compte : Gly-Ala et Ala-Gly sont deux dipeptides différents)

Avec deux acides aminés différents, on peut obtenir quatre dipeptides si chacun peut aussi se lier à lui-même (Gly-Gly, Gly-Ala, Ala-Gly, Ala-Ala). L'hydrolyse d'un peptide permet de retrouver les acides aminés qui le constituent.

De la chaîne à la protéine

Le niveauCe qu'il décrit
PrimaireLa séquence des acides aminés
SecondaireDes repliements locaux (hélices, feuillets), stabilisés par des liaisons hydrogène
TertiaireLe repliement de toute la chaîne dans l'espace
QuaternaireL'association de plusieurs chaînes (quatre pour l'hémoglobine)

La forme en trois dimensions détermine l'action : le site actif d'une enzyme, le site de fixation d'un anticorps. Une protéine dénaturée (chaleur, pH extrême) perd sa forme et sa fonction. Un seul acide aminé changé peut suffire à modifier la fonction (drépanocytose).

Les acides gras

Un acide gras est un acide carboxylique à longue chaîne carbonée, R–COOH.

L'acide grasSa structureExemple
SaturéAucune double liaison C=CAcide palmitique, acide stéarique
Mono-insaturéUne double liaisonAcide oléique (huile d'olive)
PolyinsaturéPlusieurs doubles liaisonsOméga 6 (acide linoléique), oméga 3 (acide alpha-linolénique), dits essentiels car l'organisme ne sait pas les fabriquer

Les triglycérides

Un triglycéride est un triester formé à partir du glycérol (un trialcool) et de trois acides gras.

Hydrolyse : triglycéride + 3 H₂O ⇌ glycérol + 3 acides gras (réaction lente et limitée, accélérée par des enzymes, les lipases)

Saponification : triglycéride + 3 (Na⁺ + HO⁻) → glycérol + 3 (R–COO⁻ + Na⁺), le savon (réaction totale, à chaud)

Rendement = quantité de produit obtenue ÷ quantité maximale attendue

Exemple : 1,0 mol de triglycéride peut donner au plus 3,0 mol de savon ; si l'on en obtient 2,4 mol, le rendement est 2,4 ÷ 3,0 = 80 %.

Lipides et santé

  • Un excès d'acides gras saturés et d'acides gras trans (industriels) augmente le « mauvais » cholestérol et le risque cardio-vasculaire.
  • Les oméga 3 (colza, noix, poissons gras) sont bénéfiques ; il faut un bon rapport oméga 6 / oméga 3.
  • Les huiles riches en acides gras polyinsaturés se dégradent à forte chaleur : on les réserve à l'assaisonnement.
  • Le cholestérol est un stérol (quatre cycles, un groupe –OH) presque insoluble dans l'eau : il circule dans le sang porté par des lipoprotéines (LDL vers les tissus, HDL vers le foie). En excès, il se dépose dans les artères (athérome).

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6 questions pour vérifier

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  1. 1.Qu’est-ce qu’un acide α-aminé ?

  2. 2.Un carbone asymétrique est lié à :

  3. 3.Quel acide aminé n’est pas chiral ?

  4. 4.En représentation de Fischer (–COOH en haut), l’acide aminé L a son groupe –NH₂ :

  5. 5.Comment se forme une liaison peptidique ?

  6. 6.Combien de dipeptides différents peut-on former avec deux acides aminés différents, en comptant les associations d’un acide aminé avec lui-même ?

0 / 6 questions

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