Biotechnologies (STL) · Première · 3 – Caractériser pour identifier les micro-organismes
Nommer et identifier les micro-organismes par leur morphologie
Un nom, une forme, un groupement.
En bref
Identifier un micro-organisme, c’est lui donner son nom exact à partir de ses caractères.
Identifier un micro-organisme, c’est lui donner son nom exact à partir de ses caractères. En première, on s’appuie surtout sur les caractères morphologiques, observés sur une souche pure.
Les règles de nomenclature
Chaque espèce porte un nom binomial en latin :
- le genre avec une majuscule, puis l’espèce en minuscule : Escherichia coli ;
- en italique à l’écrit tapé, souligné à la main ;
- après une première mention, le genre peut s’abréger : E. coli ;
- « sp. » désigne une espèce non déterminée d’un genre : Bacillus sp.
Les noms de familles se terminent en -aceae et s’écrivent sans italique obligatoire, avec une majuscule : Enterobacteriaceae.
La hiérarchie de la classification
Domaine → phylum → classe → ordre → famille → genre → espèce. Chaque niveau est un taxon. Plus on descend, plus les individus se ressemblent.
Un dendrogramme représente la proximité génétique : on y lit un pourcentage de similitude entre souches. Par exemple, deux souches à plus de 97 % de similitude de leur ADN ribosomique appartiennent souvent à la même espèce.
Les caractères morphologiques des bactéries
| Critère | Possibilités |
|---|---|
| Forme | coques (sphériques), bacilles (bâtonnets), coccobacilles, spirilles (spirales), vibrions (virgules) |
| Taille | ≈ 1 µm pour les coques, 2 à 5 µm de long pour les bacilles |
| Mode de groupement | isolés, diplocoques (par deux), chaînettes (streptocoques), amas en grappe (staphylocoques) |
| Gram | positif (violet) ou négatif (rose) |
| Mobilité | à l’état frais |
Le mode de groupement vient du mode de division : des coques qui se divisent toujours dans le même plan forment des chaînettes, dans plusieurs plans des amas.
Distinguer levure et bactérie
| Levure | Bactérie | |
|---|---|---|
| Taille | 5 à 10 µm | ≈ 1 µm |
| Forme | ovale ou ronde | coque, bacille… |
| Bourgeon | souvent | jamais |
| Noyau | oui (peu visible sans coloration) | non |
Un état frais de kéfir ou de levain montre à la fois de grosses cellules ovales bourgeonnantes (levures) et de petits coques (bactéries lactiques).
Aller plus loin : les caractères métaboliques
La morphologie ne suffit pas toujours : deux bacilles Gram négatif peuvent être très différents. On complète par des caractères culturaux (aspect des colonies, croissance sur milieux sélectifs) et métaboliques (fermentation des sucres, enzymes) : ce sera le programme de terminale.
Exemple
Coloration de Gram : coques violets en grappes, environ 1 µm. Conclusion morphologique : coques Gram positif en amas, orientation vers le genre Staphylococcus. Pour aller jusqu’à l’espèce, il faudra des tests complémentaires.
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6 questions pour vérifier
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1.Comment écrit-on correctement le nom de la bactérie du côlon ?
2.Dans le nom Staphylococcus aureus, « Staphylococcus » est…
3.Les noms de familles bactériennes se terminent par…
4.Des coques en grappe évoquent le genre…
5.Des coques en chaînettes évoquent le genre…
6.« Bacillus sp. » signifie…
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